妒殺韓非
　　正當(dāng)李斯步步高升的時候，秦王卻十分喜愛韓非的才華。韓非和李斯是同學(xué)，他繼承了荀子的學(xué)說，并在此基礎(chǔ)上，把慎到的“勢”，商鞅的“法”，申不害的“術(shù)”結(jié)合起來，并加以豐富和發(fā)展，形成了一套完整的君主專制理論。韓非是戰(zhàn)國末期的一位大思想家，學(xué)問比李斯大得多。韓非因說話口吃，不善辯說，但善于著述。韓非回到韓國以后，看到韓國太弱，多次上書獻(xiàn)策，但都未能被采納。于是，韓非發(fā)憤著書，先后寫出《孤憤》、《五蠹》、《說難》等。他的書傳到秦國，由于講的都是“尊主安國”的理論，秦王非常贊賞韓非的才華，并說：“我要是能見到此人，和他交往，死而無恨?！辈痪茫蚯貒ロn，韓王不得不起用韓非，并派他出使秦國。秦王很喜歡韓非，但還沒有決定是否留用。李斯知道韓非的本事比自己大，害怕秦王重用他，對自己的前途不利，就向秦王講韓非的壞話。他說：“韓非是韓王的同族，大王要消滅各國，韓非愛韓不愛秦，這是人之常情。如果大王決定不用韓非，把他放走，對我們不利，不如把他殺掉。”秦王輕信李斯的話，把韓非抓起來。根據(jù)秦國法令的規(guī)定，獄中的囚犯無權(quán)上書申辯。韓非到秦國以后，又得罪了姚賈。姚賈為秦國立過功，深得秦王的重用，被任命為上卿。韓非卻向秦王說，姚賈出身不高貴，當(dāng)過大盜，在趙國做官時被趕跑了，認(rèn)為用這樣的人是很不應(yīng)該的，使得秦王很掃興。事后秦王又向姚賈問起韓非，姚賈當(dāng)然不會講韓非的好話。在李斯和姚賈的串通下，韓非沒有辦法，只好吃了李斯送來的毒藥，自殺而死。從此以后，李斯沒有對手，更可以施展自己的才能，為秦王統(tǒng)一六國出謀劃策了。郡縣制與焚書秦王政二十六年（前221年），秦王結(jié)束了長期分裂的割據(jù)局面，統(tǒng)一了中國，建立了一個東到大海，南達(dá)嶺南，西至甘青高原，北至今內(nèi)蒙古、遼東的空前的大一統(tǒng)國家。秦王，這時已稱為秦始皇了。為了鞏固這個統(tǒng)一的國家，李斯也是做了一定貢獻(xiàn)的。
　　（另有一說，李斯一直想將韓非留在秦國，等秦滅韓之后再為秦國所用。但由于韓非之書《韓非子》對于帝王之術(shù)、統(tǒng)治之術(shù)的分析過于透徹，導(dǎo)致秦王嬴政對其才華感到恐懼，加上韓非的三條不利于秦國發(fā)展的建議、姚賈的陷害，使秦王政將韓非下獄拷打。李斯實心欲救韓非，曾幫韓非呈韓非絕筆之作《初見秦》于秦王政，無奈秦王政鐵心欲除韓非。后秦王政以韓非書中《八經(jīng)》之三中除“陰奸”之術(shù)施于韓非：令李斯去處理韓非一案（結(jié)合之前所言即讓李斯殺死韓非），嫁禍于李斯，從而不背罵名。李斯無奈，只得從命而下毒于韓非飲食，使韓非暴斃而亡。）
　　這一說法出自曹升的《流血的仕途》一說，但爭議頗大。
　　歷史上對于《初見秦》一書的作者多有歧義，有范雎作，荀子作，呂不韋作，張儀作等多種說法。但基本可以肯定的是并不是韓非本人親筆。（理由有四：1.《初見秦》文中十次稱秦昭襄王為“大王”，但韓非在秦昭襄王時期并未到秦，此其一也。2.文中曾提到“舉趙而韓亡”，這種“亡韓”的觀點與韓非向來“存韓”的觀點并不相符，此其二也。3.文中曾提到“逾羊腸，降代、上黨”“上黨六十七縣，不用一領(lǐng)甲，不苦一士民，此皆秦有也”。公元前261年，韓割上黨郡以向秦求和。而韓非入秦應(yīng)為公元前234年左右，作為《說難》一文的作者，相信他不會勸說秦王占領(lǐng)已經(jīng)屬于秦國的土地。4.《初見秦》一文與《戰(zhàn)國策 張儀說秦王》相似度極高）。

焚書
　　秦始皇三十四年（前213年），群臣聚集在咸陽宮稱頌秦始皇時，博士淳于越很不知趣，向秦始皇說：殷周之所以存在千年，是因為它把天下分封給子弟和功臣。天下如此之大，宗室子弟沒有封地，和百姓一樣，萬一發(fā)生了齊國陳恒、晉國六卿之變，又有誰來相救呢？凡是不以古為師而天下能長久的，沒有聽說過。淳于越是以儒家的立場來看待秦朝的政治，同秦始皇的思想和行動是格格不入的，使得秦始皇大為不滿，把淳于越交給丞相李斯處理。李斯不贊同淳于越的看法，他向秦始皇闡述了自己的觀點。他認(rèn)為：由于時代的變化，五帝三代的治國辦法也不同。三代時期的做法，也并不值得效法。那時候諸侯并列，互相爭奪，天下統(tǒng)一，情況完全不同，不必效法古代。以古非今，攪亂民心。對于造謠惑眾，不利于統(tǒng)一天下的言行必須禁止，否則將會影響政局的穩(wěn)定，有損于皇帝的權(quán)威。最后，他又把這一切都?xì)w罪為讀書的緣故，建議秦始皇下令焚書。
　　按照李斯制定的法令，那是相當(dāng)殘苛的。凡是秦記以外的史書，不是博士（指掌管古今文史典籍的官）所藏的詩、書、百家語都要燒掉，只準(zhǔn)留下醫(yī)藥、卜筮、種樹之書。此后，如果有敢再談?wù)撛姇摺皸壥小保ㄖ冈隰[市區(qū)執(zhí)行死刑，并將尸體暴露街頭，稱為棄市）；“以古非今者族，（指一人有罪，父母兄弟妻子皆受刑，稱為族）”；官吏如果知道而不檢舉者，與之同罪；令下后三十日仍不燒者，黥(意為用刀刺刻額頰等處)再潦上墨為“城旦”（一種刑罰，輸邊筑長城四年）。有想學(xué)習(xí)法令的，要以吏為師。
　　這次焚書的原因，是由于討論是否分封的問題而引起的，無論是主張分封還是反對分封的大臣，都是為了秦始皇長久統(tǒng)治打算，他們并無根本利益上的對立。李斯借題發(fā)揮，最后竟造成焚書的結(jié)局，也不是沒有緣由的。
　　秦國自商鞅變法以來，一直是以法家理論作為治國的指導(dǎo)思想。秦始皇統(tǒng)一天下之后，也是以法家治國的。在他當(dāng)皇帝的九年中，主要精力是用在建立中央專制政權(quán)，劃定全國疆域，統(tǒng)一文字度量衡，修筑長城等，對文化思想方面很少注意。淳于越以儒家思想為秦始皇出謀劃策，是不利于秦的中央集權(quán)統(tǒng)治的。因此，善于領(lǐng)會秦始皇意圖的李斯，為了打擊儒家勢力，鞏固統(tǒng)一政權(quán)，提出了上述焚書的主張，得到了秦始皇的同意和批準(zhǔn)。于是，秦始皇下令焚書，先秦許多文獻(xiàn)古籍都被燒掉了，使中國文化遭到了巨大的損失。然而，另一方面秦始皇也曾將一些禁書收藏在咸陽皇家圖書館，使得部分珍貴書籍得以保存了下來。